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企业自主创新是我国实施建设创新型国家战略的重中之重,但是企业自主创新不仅仅是企业的事情,而且还涉及到高校、科研机构等等不同的组织。本文正是从自主创新中企业与高校、科研机构之间存在的关系出发,阐述了不同自主创新模式下,企业、高校和科研机构之间的合作关系,同时进一步分析了产学研之间的联结问题。