【摘 要】
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从葫芦科基因组数据库下载513801条黄瓜EST,经EST—trimmer软件和CD—HIT程序预处理.共获得381022条非冗余EST。利用Perl程序MISA搜索到SSR位点15665个,检出率为4.11%。单、二和三
【机 构】
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江西农业大学理学院.江西南昌330045,江西农业大学农学院作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室
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从葫芦科基因组数据库下载513801条黄瓜EST,经EST—trimmer软件和CD—HIT程序预处理.共获得381022条非冗余EST。利用Perl程序MISA搜索到SSR位点15665个,检出率为4.11%。单、二和三核苷酸重复为主导类型,占EST—SSR总数的95.98%。A/T、AG/CT和AAG/CTT作为单、二和三核苷酸的优势重复基元,分别占EST—SSR总数的21.43%、15.68%和19.27%。
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