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滇池和抚仙湖构造条件基本相同且处于相同的气候区，自然沉积环境差别不大。但目前两湖所面临的环境压力和受污染程度相差较大，这与人类活动强度的差异密切相关，这体现了人类活动与自然环境之间的整体性，但不同的人类活动对湖泊环境的影响程度是不同的，这体现了其差异性。本文通过对比近20年云南省昆明市和玉溪市两市的各项主要经济指标，分析出两个湖泊沉积环境受人类活动影响的差异，并分析其发展趋势。为滇池、抚仙湖治理过程中的截污、控源、生态修复提供相关依据。