寨卡病毒E、NS5蛋白生物信息学分析

• 作 者: 邹淑慧 李金亮 廖莎莎 张丽琴 刘聪
• 机 构: 赣州市人民医院检验科
• 出 处: 实验与检验医学
• 发表日期: 2019年6期
• 关键词: 寨卡病毒 E蛋白 NS5蛋白 生物信息学
• 基金项目: 赣州市指导性科技计划项目(GZ2018ZSF192)

目的对寨卡病毒(ZIKV)E蛋白和NS5蛋白序列进行生物信息学比较研究,并分析其意义。方法利用多种生物信息在线分析工具和软件包对ZIKV E、NS5基因及编码蛋白与其他黄病毒属代表株序列比对,计算核苷酸和氨基酸同源性。预测ZIKV E、NS5蛋白跨膜区、信号肽与二级结构以及B细胞表位。结果不同地理株的ZIKV E蛋白核苷酸和氨基酸同源性分别为87.1%~100%和94.2%~100%,与黄病毒属中Spondweni病毒最接近,氨基酸同源性最高达72.8%。不同地理株的ZIKV NS5蛋白核苷酸和氨基酸同源