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以44份香料烟品种资源为材料。利用ISSR分子标记技术进行了遗传多样性分析。结果表明：100个ISSR引物中可筛选出8个核心引物，在44份香料烟品种中扩增出223个片段，其中209个具多态性。供试香料烟品种的遗传相似系数在0．51～0．96之间，平均为0．79。当相似系数为0．636时，44份香料烟品种可分为两大类，表明44份香料烟品种间的遗传多样性低，急需通过引种及种质创新等手段来丰富香料烟品种的遗传多样性。