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目的明确2013-2015年单县HFMD的病原体型别构成及分布特征。方法采集临床诊断为手足口病病例的粪便或肛拭子样本,用实时荧光定量PCR方法进行肠道病毒通用(EV)型、EV71型、CA16型的核酸检测,并对结果进行分析。结果对194例临床HFMD病例样本检测,肠道病毒核酸阳性177例(91.24%)。2013和2015年优势毒株是EV71,其所占比例分别是88.24%和56.94%。2014年优势毒株是CA16,其所占比例是48.15%。三个年份中其他肠道病毒所占的比例分别是11.76%、29.63%和