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全麻药的作用比通常认为的更具有选择性，可能与中枢神经系统内极少的靶位相结合而起效，临床应用浓度全麻药为要作用于配体门控性（而不是电压门控性）离子通道，增强突触后抑制性通道的作用，这与全麻时进行的药理学观测非常符合，尽管第二信使系统在全麻机理中的作用尚未确定，但现已明确，全麻药可直接作用于蛋白质，而不是脂质。