AP数据源融合算法构建基因调控网络

• 作 者: 郑明 刘桂霞 卓慕瑰
• 机 构: 梧州学院广西高校行业软件技术重点实验室,吉林大学计算机科学与技术学院
• 出 处: 吉林大学学报:理学版
• 发表日期: 2019年5期
• 关键词: AP算法 数据源融合 基因调控网络 全基因组关联 AP algorithm data source fusion gene regulatory network
• 基金项目: 国家自然科学基金(批准号:61862056),广西自然科学基金(批准号:2017GXNSFAA198148),梧州学院科研项目(批准号:2017B001).

针对单一数据集构建基因调控网络算法数据量不足及构建网络结果不精确的问题,提出一种基于能力与信任(AP)的数据源融合算法.该算法将基因表达数据、蛋白质相互作用数据和基序数据集,分别通过控制与被控制双向数据流传输来分析和构建基因调控网络,并与ReMoDiscovery,CLR和C3Net三种已开发模型在酵母全基因组网络构建结果的AUC值进行对比.对比结果表明,该算法在构建基因调控网络算法方面执行效率更高、收敛性更强.