【摘 要】
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为了完善天人菊的遗传信息,丰富菊科植物分子生物学分析数据.通过PCR扩增、基因克隆获得天人菊matK基因的完整核苷酸序列,采用生物信息学方法分析天人菊matK蛋白的结构及性质,并与其他12种matK氨基酸序列进行对比,构建系统进化树.结果表明,天人菊matK基因全长1296 bp,可编码432个氨基酸,二级结构以α-螺旋为主,无跨膜结构,无信号肽,是不稳定亲水性蛋白,存在于叶绿体中,matK氨基酸序列在不同的生物种类中具有高度的保守性.天人菊matK蛋白与遗传距离较近的菊科植物蛋白相比仅有15处氨基酸变异
【机 构】
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云南民族大学 民族医药学院,云南 昆明650500
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为了完善天人菊的遗传信息,丰富菊科植物分子生物学分析数据.通过PCR扩增、基因克隆获得天人菊matK基因的完整核苷酸序列,采用生物信息学方法分析天人菊matK蛋白的结构及性质,并与其他12种matK氨基酸序列进行对比,构建系统进化树.结果表明,天人菊matK基因全长1296 bp,可编码432个氨基酸,二级结构以α-螺旋为主,无跨膜结构,无信号肽,是不稳定亲水性蛋白,存在于叶绿体中,matK氨基酸序列在不同的生物种类中具有高度的保守性.天人菊matK蛋白与遗传距离较近的菊科植物蛋白相比仅有15处氨基酸变异位点,而与遗传距离较远的加州玫瑰和北美黑莓对比存在138处氨基酸变异位点,且基因的5\'端氨基酸变异频率低于3\'端.基因本体论分析可知matK蛋白在13种不同的生物中可靠度为60% ~70%,具有多种分子功能,并参与了众多的生物学过程.对天人菊matK基因进行了深入的分析,为天人菊的进一步研究提供了理论依据.
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