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在开发出莲基因组SSR引物对的基础上，采用SSR分子标记技术尝试鉴别10个藕莲推广品种。筛选出16对SSR有效引物进行PCR扩增，其中6对引物CL1、CL2、CL4、CL9、CL14、CL16共扩增出15条多态性条带，对所得到的10个藕莲品种的SSR指纹图谱进行组合和综合分析，可以将供试的10个品种区分开来。表明利用SSR技术进行藕莲品种鉴定是可行而有效的。