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目的：分析病毒性心肌炎儿童心率变异性。方法选取我院自2012年4月-2014年4月间我院收治的98例病毒性心肌炎心率变异性患者作为观察组研究对象，选取同期的98例进行身体检查的98例正常儿童作为对照组进行心率对比。结果观察组患儿的最慢心率明显高于对照组，数据对比差异具有统计学意义，P＜0.05；最快心率对比差异不明显，在3-7岁的年龄阶段观察组患儿的间期值标准差（SDANN）中心率变异性指标（HRV）没有发生变化，其他的HRV指标均明显降低，数据对比差异具有统计学意义，P＜0.05。结论患儿的年龄段不同则HRV病毒指标也会出现差异，因此在临床治疗过程中应该充分考虑这一特点，从而进行有效的诊断和治疗。