2015-2018年上海市环境污水中非脊髓灰质炎肠道病毒的分布及柯萨奇病毒B5的分子特征

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目的 分析2015-2018年上海市闵行区和嘉定区环境污水监测中非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV)的分布特征,探讨环境污水、健康儿童和急性弛缓性麻痹(AFP)病例监测中柯萨奇病毒B组5型(Cox B5)分离株之间的关系和变迁规律.方法 选择上海市闵行区和嘉定区污水处理厂作为长期固定监测点,每月采集监测点的污水进行浓缩富集,取上清液并接种于人横纹肌肉瘤细胞(RD)和人喉癌上皮细胞(Hep-2)进行病毒分离.通过反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)获得VP1区序列并进行分析.结果 2015-2018年共采集污水样本84份,共分离242株NPEV,包含19个基因型,Cox B5为比例较高的基因型,占18.18%(44/242).2015-2018年,环境污水、健康儿童和AFP病例监测中的Cox B5分离株形成2个基因型和3个传播链,即C3、C4和D3基因亚型.C3基因亚型在上海市属于优势基因亚型,而D3基因亚型是2016-2018年新出现的传播链.结论 2015-2018年上海市2个区环境污水中常见的优势基因型为ECHO 11、Cox B5、Cox B3和ECHO6.Cox B5在环境污水、健康儿童和AFP病例中存在共循环现象.我国尚未建立完善的NPEV相关疾病监测系统,环境污水监测可作为病例监测的重要补充方法.
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