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本文概述了当前分支系统学研究中涉及的主要理论和方法，包括性状的选取、性状状态和极性的确定、数据矩阵的分析计算、结果分支图的处理、分支图可靠性的评价及分支图的应用。本文同时以华东地区樟科山胡椒属Ｌｉｎｄｅｒａ１２个种的分支系统学研究为例，讨论了用形态性状进行分支系统学研究中可能遇到的问题，也揭示了一些分支系统学与传统的系统学在应用性状推导进化关系上的不同点。对这１２个种的分支系统学研究得出了一些不同