【摘 要】
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目的:全方位了解脓毒症发生发展机制,从而筛选相关核心基因,为临床治疗脓毒症提供新靶点。方法:从基因表达数据库(GEO)中获取GSE28750芯片数据,使用GCBI在线实验室筛选出差异
【基金项目】
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泸州市-西南医科大学联合项目(2015LZCYD-S05(11/12))
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目的:全方位了解脓毒症发生发展机制,从而筛选相关核心基因,为临床治疗脓毒症提供新靶点。方法:从基因表达数据库(GEO)中获取GSE28750芯片数据,使用GCBI在线实验室筛选出差异表达基因,分别使用基因本体论分析(GO分析)、代谢通路分析(pathway分析)、基因信号网络分析、共表达分析对所获得基因进行分析。结果:与对照组相比,脓毒症组共获得2 457个差异表达基因,其中上调基因1 282个、下调基因1 175个;差异表达基因主要涉及免疫反应、细胞分化、血液凝固等方面;pathway分析发现核心信号通路主要涉及物质代谢、信号转导、抗感染等方面;基因信号网络分析发现核心基因为:GNAI3、PIK3CB、MAPK14、IL8;共表达网络分析推测核心基因为GYG1、SERPINB1、SAMSN1、ATP11B。结论:生物信息学有助于全面深入研究疾病发生机制,筛选可能的核心靶点,为临床治疗脓毒症提供参考。
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