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科克赛铜钼矿位于赛里木湖铜铅锌成矿带,西邻环巴尔喀什湖成矿带,该区发现多处中-小型铜钼矿及铅锌矿。科克赛铜钼矿是近年来发现的斑岩型铜钼矿,本次工作划分4个矿化带,圈定21条矿(化)体。对该矿床成因研究后,初步认为科克赛铜钼矿与晚古生代构造-岩浆活动关系密切,是典型斑岩型铜钼矿,成矿作用发生于晚石炭—早二叠世的岩浆活动,成矿物质来源于加厚下地壳的部分熔融。