【摘 要】
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【目的】研究南海硇洲岛马粪海胆(Hemicentrotus pulcherrimus)可培养细菌多样性。【方法】采用纯培养法和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对样品中细菌(含放线菌)多样性
【机 构】
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吉首大学植物资源保护与利用湖南省高校重点实验室生物资源与环境科学学院; 云南大学云南省微生物研究所教育部微生物多样性可持续利用重点实验室;
【基金项目】
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国家自然科学基金(30970007);国际合作重大项目(2007DFB31620);湖南省重点学科建设项目(JSS2009Z01);吉首大学项目(jsdxkyzz200811,08JDY017)~~
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【目的】研究南海硇洲岛马粪海胆(Hemicentrotus pulcherrimus)可培养细菌多样性。【方法】采用纯培养法和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对样品中细菌(含放线菌)多样性进行研究。【结果】用补充0～2.0mol/LNaCl的MA、ISP2、NA、SWA和HAA培养基从海胆样品中分离到106株细菌菌株,根据形态观察和部分生理生化实验结果去冗余,选取34个代表性菌株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育多样性分析。结果表明,这些分离菌株代表21个物种,属于3个大的系统发育类群(Firmicutes,Actinobacteria,Gamma-Proteobacteria)的10个科、17个属。多数菌株属于Firmicutes门(21株,58.8%)和Actinobacteria门(9株,26.5%)。大多数菌株与其系统发育关系最密切的已知物种的典型菌株之间存在一定的遗传差异(16S rRNA基因序列相似性为99.6%～99.9%),其中至少有5个菌株(JSM076033,JSM076056,JSM076093,JSM078063和JSM078169)代表潜在的新分类单元(potential new taxa)。【结论】研究结果表明,南海硇洲岛海胆中存在较为丰富的细菌多样性,并且潜藏着较多的新的微生物类群(物种)。
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