【摘 要】
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为探究牦牛和犏牛生鲜乳中微生物的组成和多样性,采用高通量测序技术分析两种生鲜乳的16S rDNA V4区域,并进行生物信息学对比分析.结果显示:97％的一致性共得到5516个OTUs,微生
【机 构】
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青海大学畜牧兽医科学院,青海西宁 810016;青海高原牦牛研究中心,青海西宁 810016;青海省高原放牧家畜动物营养与饲料科学重点实验室,青海西宁 810016
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为探究牦牛和犏牛生鲜乳中微生物的组成和多样性,采用高通量测序技术分析两种生鲜乳的16S rDNA V4区域,并进行生物信息学对比分析.结果显示:97％的一致性共得到5516个OTUs,微生物门水平的比较表明变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)及放线菌门(Actinobacteria)为牦牛乳和犏牛乳共同的优势菌门,牦牛乳三种微生物的相对丰度分别为29.80％、35.99％及8.41％,犏牛乳为45.36％、25.79％及7.39％;在属水平上,牦牛乳的优势菌属为未分类的蓝藻细菌属(unidentified-Cyanobacteria),相对丰度为9.32％,犏牛乳的优势菌属为慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium),所占比例为11.53％;在种水平上,埃尔坎尼中慢生根瘤菌种(Bradyrhizobium elkanii)和Kosakonia oryzae为牦牛乳和犏牛乳中共有的优势菌种,两种菌种在牦牛乳中分别占比2.42％、3.36％,在犏牛乳中分别占比11.53％、5.53％;Alpha多样性分析表明不同牛乳丰度估计值存在显著差异(P<0.05),且犏牛乳的丰富度及多样性较高.
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