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通过对我国正在使用的１２个玉米骨干自交系的ＲＡＰＤ分析，从２２０个Ｏｐｅｒｏｎ引物中筛选出１２个能产生稳定的遗传多态性的引物，利用这些引物扩增出的指纹图谱，进行聚类分析，可将全部供试自交系分成３个类群，第１类群包括黄早４系统的５个自交系；第２类群包括４７８和４８８两个姊妹系；第３类群包括５个关系较远的自交系，其中３个来自美国，１个是全部中国血统，１个既有美国血统又有中国血统。这个结果与根据各个自交