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恶性疟原虫裂殖子表面蛋白1（MSP1）和2（MSP2）是恶性疟原虫无性红内期重要的候选疫苗组分。为设计制作安全有效的恶性疟疫苗提供理论依据，根据文献报道的恶性疟原虫MAD20 MSP1和FC27 MSP2 DNA序列设计并合成两对引物，对中国恶性疟原虫云南省勐腊县勐罕分离株CMH1/YN和海南省昌江县FCC1/HN分离株MSP1第13～17区基因和MSP2基因进行聚合酶链反应（PCR）扩增及鉴定。PCR产物进一步根据含单一酶切位点EcoRI和XbaI进行酶切鉴定，确证为目的基因，扩增序列分别为1.7Kb和0.8Kb。结果发现中国恶性疟原虫CMH1/YN和FCC1/HN分离株MSP1第13～17区基因和MSP2基因与巴布亚－新几内亚恶性疟原虫株MAD20和FC27在这个区域内的基因一致，表现出高度同源性。这一发现为开发预防恶性疟的疫苗和药物奠定了基础。