秀丽小杆线虫分泌蛋白组的计算机分析

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结合计算机技术和生物信息学的方法,采用组合的信号肽分析软件SignalP V3.0、TargetP V1.01、Big-PI Predictor和TMHMM V2.0,预测了秀丽小杆线虫(Caenortheditis elegans ws123)的全基因组19855个ORF编码蛋白的信号肽,同时系统分析了信号肽的特征。结果表明,在19855个秀丽小杆线虫的蛋白中,有1990条为带有信号肽的分泌型蛋白,其中,1936条为典型的分泌型信号肽(即信号肽酶Ⅰ型信号肽),53条为信号肽酶Ⅱ型信号肽,1条为信号肽酶Ⅳ
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