基于P2HP平台的蛋白质折叠分布式计算

• 作 者: 刘宇 吕志鹏 罗飞
• 机 构: 武汉科技大学计算机学院,华中科技大学计算机学院
• 出 处: 计算机工程
• 发表日期: 2008年9期
• 关键词: 蛋白质折叠 分布式计算 对等网络 protein folding distributed computing P2P network

通过对基于格点模型的PERM算法进行定性分析，提出并行化计算PERM算法的策略。该策略保存了PERM算法中最关键的平均权重向量，并分发至多个计算单元进行模拟运算，从而达到减少计算时间、提高运算结果精确度的目的。以P2HP为计算平台，对多条蛋白质序列进行模拟运算。实验结果表明，基于PERM的蛋白质折叠并行计算方法能够在P2HP平台上获得较优的性能。