珍珠鸟（Taeniopygiaguttata）Z染色体基因表达的密码子用法

• 作 者: 王樟凤 柴学文 彭武林 黄润红 饶友生
• 机 构: 南昌师范学院生物技术研究所
• 出 处: 江西农业大学学报
• 发表日期: 2013年6期
• 关键词: 珍珠鸟 Z染色体 密码子 用法 zebra finch Z chromosome codon usage
• 基金项目: 江西省教育厅科学技术研究项目（GJJl2658）和江西省自然科学基金项目（2010GZN0021）

从EMBL数据库下载珍珠鸟（ Taeniopygia guttata） Z染色体全部基因的cDNA序列，共有610个基因的CDS序列纳入统计分析。使用CodonW （1．4．2）对CDS序列进行密码子偏性研究，确定了UUC、CUC、CUG等28个密码子为珍珠鸟Z染色体基因表达的“最优”密码子。对应分析表明，影响珍珠鸟Z染色体基因表达的密码子用法的主要因素分别为GC3s（同义密码子第3位的G C频率）、CDS的GC含量以及基因的表达水平。据此推论，珍珠鸟Z染色体基因表达的密码子偏性是核苷酸组成和选择等因素综