澳洲坚果MYB1基因克隆及生物信息学分析

• 作 者: 王文林 韦媛荣 郑树芳 谭秋锦 覃振师 黄锡云 汤秀华 樊松
• 机 构: 广西南亚热带农业科学研究所,农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地—海南省热带作物栽培生理学重点实验室/农业农村部儋州热带作物科学观测实验站/中国热带农业科学院
• 出 处: 南方农业学报
• 发表日期: 2020年2期
• 关键词: 澳洲坚果 MiMYB1基因 R2R3-MYB家族 SANT保守结构域 抗逆性 Macadamia integrifoliaMiMYB1 geneR2R3-MYB
• 基金项目: 国家重点研发计划项目(2016YFC0502406),广西科技基地和人才专项(桂科AD18281087),广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2020YM46),崇左科技计划项目(崇科攻2019039)

【目的】从澳洲坚果(Macadamia integrifolia)叶片中克隆MYB1转录因子基因(MiMYB1)并进行生物信息学分析,为揭示R2R3-MYB家族转录因子成员在澳洲坚果中的抗逆作用机制提供参考依据。【方法】利用PCR从澳洲坚果品种桂热一号叶片中克隆MiMYB1基因,采用ProtParam、TMHMM Server v.2.0和SMART:Main page等在线分析软件对MiMYB1蛋白进行生物信息学分析,运用DNAMAN 7.0进行蛋白氨基酸多序列比对分析,并从NCBI中选取126个拟南芥