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利用SSR标记对37个云南糯玉米地方品种遗传多样性和遗传关系进行研究，和5个国内主要自交系进行优势群的划分。结果表明：从国内外所用的63对核心引物中筛选出PIC值高、稳定的20对玉米核心SSR引物扩增出225个等位基因，平均多态信息量PIC值为0．87、标记索引系数MI值9．91、Shannon多样性指数，为0．54；37个云南糯玉米地方品种可划分为5大类群13个小类群；少数的云南糯玉米种质资源与常见的5大杂种优势群的遗传距离较近，而大多数资源则较远，可形成多个单独的类群，云南糯玉米地方种质资源具有广泛的