肝癌患者RBP7基因的表达意义及与预后的关系研究

来源 :昆明医科大学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:w527369
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  摘要:目的:分析肝癌患者视黄醇结合蛋白7(RBP7)基因表达情况与预后的关系。方法:于TCGA、ICGC数据库分别下载421例、232例肝癌及癌旁组织RNA测序的数据以及相关的临床数据,分析肝癌组织及癌旁组织RBP7基因表达情况以及RBP7基因表达情况与预后的关系。TCGA数据库中的数据作为训练组,ICGC数据库中的数据作为验证组。结果:总共653例样本纳入本次研究,在训练组中,与癌旁组织相比,RBP7基因在肝癌组织中的表达明显升高,有明显的差异性(P<0.001),具有显著的统计学意义。RBP7在验证组中同样表现出明显的差异性(P<0.001)。通过KM生存曲线分析发现,肝细胞肝癌患者RBP7基因表达越低,生存率越低,预后越差。结论:RBP7基因可以作为肝癌预后生物标志物,其表达水平能够用于提示患者的生存率,对判断患者预后具有参考价值。
  关键词:肝细胞;肝癌;视黄醇结合蛋白7(RBP7);预后
  【中图分类号】R73                          【文献标识码】A               【文章编号】2107-2306(2020)01-157-02
  肝癌全球发病率处于第6位,是第4大全球肿瘤患者主要死亡原因之一。由于早期诊断困难,缺乏有效的治疗措施,异质性大,发生发展机制较为复杂,肝癌患者预后较差,肝癌5年生存率不足5%。近年来的研究指出某些癌基因的激活(ras基因及c-myc基因)及抑癌基因(P_53基因)的失活在肝癌的产生过程中起重要作用[1]。RBP7在肾细胞脂肪组织,乳腺中差异表达中差异表达,且在肝癌增殖和转移方面起着重要的作用。可能与肝癌患者的预后相关。最近的研究表明一些CRBP成员和视黄醇信号可能是与结肠癌进展和癌症干细胞性状相关[2]。然而,RBP7基因在肝癌中的表达与预后情况尚不清楚。
  1材料与方法
  1.1数据库资料收集
  从TCGA数据库及ICGC数据库分别下载421例、232例肝癌与癌旁组织转录组数据及其临床性状。观察在训练组和验证组中肝癌组织和癌旁组织RBP7基因的表达情况。对TCGA数据库中的数据进行生存分析,分析癌旁组织与肝癌組织中RBP7基因表达情况与预后关系。
  1.2统计学方法
  所有数据采用R语言软件进行统计学分析,RBP7基因表达与肝癌预后的关系采用K-M生存曲线分析。P<0.05表示研究有统计学意义。
  2结果
  2.1 RBP7基因在数据库中表达情况
  综合分析TCGA数据库(图1),可发现RBP7基因在肝癌组织及癌旁组织中差异表达(如图1)对比肝癌组织和癌旁组织,RBP7基因表达在肝癌组织中明显高于癌旁组织。同时对ICGC数据库中包含232例样本的数据组作为验证组,结果表明RBP7基因在癌旁和癌组织中差异表达(P<0.001)。
  2.2 RBP7基因表达情况与肝癌患者预后的关系
  在TCGA数据库中,对432例肝癌患者进行K-M曲线生存预后分析,结果表明,RBP7基因表达水平与肝癌患者的生存率有明显相关性(如表1),其表达水平对预后存在显著影响(P<0.05),RBP7基因低表达组患者生存率更低。
  3讨论
  乙肝病毒感染是是我国发生肝癌的首要高危因素,80%以上的肝癌发生与HBV感染相关。此外,肝硬化、黄曲霉毒素暴露、吸烟、饮酒、肥胖、肝硬化等也可诱发该病。而肝癌的发生发展受多种基因的调节,是多种因素在多个阶段共同作用的结果,其中癌基因与抑癌基因的突变、失活、缺失、上调、下调等是最重要的原因之一[3]。通过数据库检索,可以发现肝癌组织及癌旁组织的差异性基因为视黄醇结合蛋白7(RBP7),可以作为一个预测指标,为临床转化奠定相应的分子基础。
  视黄醇结合蛋白是肝脏分泌的低分子蛋白,视黄醇结合蛋白和前白蛋白在肝脏结合成视黄醇-视黄醇结合蛋白-前白蛋白复合物-将肝脏内视黄醇从肝脏转运到外周组织的转载蛋白。有研究表明视黄醇结合蛋白水平能用于判断急性肝炎、重症肝炎和肝硬化疾病的预后。视黄醇结合蛋白7 (RBP7)含134个氨基酸,由RBP7基因编码,位于人类染色体1p36.22上[4]。细胞视黄醇结合蛋白(CRBP)家族被用于维持维生素A的的稳定性和代谢水平。维生素A(视黄醇)及其代谢产品涉及许多生物过程,包括上皮细胞增殖、分化、和细胞凋亡[5-6]。因此,RBP7或许与肝癌的转移和增殖有关。本研究通过挖掘并分析公共数据库与RBP7基因相关临床数据,发现RBP7基因在肝癌肿瘤中的表达量明显高于癌旁组织,表达有明显的差异性(P<0.001)。生存分析提示,RBP7基因高表达组患者生存率增高。
  综上所述,肝癌患者预后受RBP7基因表达的影响,RBP7基因高表达肝癌患者预后更好。本研究局限于多数据库联合验证RBP7基因在肝癌中高表达,及RBP7基因在对肝癌患者预后的影响。仍需大量临床标本与动物体内体外实验进一步验证和深入研究RBP7基因的作用机制。
  参考文献:
  [1]郭宽鹏, 张林, 莫丽亚, 视黄醇结合蛋白水平与非酒精性脂肪肝相关性的Meta分析[J]. 医学临床研究,2018,35(10):1873-1876.
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