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为研究紫色土中的硝化作用、总微生物和硝化微生物的群落结构,以重庆永川的酸性紫色土（p H=5.3）和中性紫色土（p H=7.2）以及四川盐亭的石灰性紫色土（p H=8.5）为研究对象,采用稳定性同位素标记技术进行培养实验,并通过Miseq测序对三种紫色土微生物群落结构进行分析。每种土样共设有三种处理,包括13CO2标记处理、12CO2对照处理和13CO2+C2H2对照处理。结果表明,中性紫色土（p H=7.2）和石灰性紫色土（p H=8.5）经过56 d的培养后发生了强烈的硝化作用,而酸性紫色土（p H=5.3）中未发生明显的硝化作用,并且硝化作用类型都以自养硝化为主。三种紫色土中都存在着变形菌门（Proteobacteria）、酸杆菌门（Acidobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、绿弯菌门（Chloroflexi）、放线菌门（Actinobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）和芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）,其中变形菌门在三种紫色土中都大约占有20%的比例。中性紫色土和石灰性紫色土各处理中硝化螺旋菌门（Nitrospirae）百分比大于酸性紫色土各处理。三种紫色土各处理中的氨氧化细菌（Ammonia-oxidizing bacteria,AOB）主要以亚硝化螺菌属（Nitrosospira）为主,亚硝酸氧化细菌（Nitrite-oxidizing bacteria,NOB）主要以硝化螺菌属（Nitrospira）为主。且NOB/AOB的值在三种紫色土各处理中最高可达到13,这意味着全程氨氧化细菌（Comammox）可能在紫色土的硝化作用中占据重要贡献。