蛋白互作与基因共调控的关联研究

• 作 者: 宿菲 吴超 徐建凯 廖明帜 张昀 刘宝全
• 机 构: 哈尔滨医科大学生物信息技术学院,150081清华大学,北京,100084;西北农林科技大学,杨凌,712100;昆明科学院植物研究所,650204
• 出 处: 国际遗传学杂志
• 发表日期: 2004年期
• 关键词: 基因共调控强度 蛋白互作比率 互作趋势

目的 通过分析2000个人类结肠癌相关基因以及GO( gene ontology)数据库中与人类生物学过程相关的25 189个基因,揭示蛋白互作比率与基因共调控强度之间的关联趋势.方法 基于四联密码子算法提取既包含蛋白互作关系又包含共调控关系的混合模式.应用超几何分布(P≤0.05)筛选出频数大于等于5且具有统计学意义的混合模式1073个.结果 蛋白互作比率与基因共调控强度之间存在明显的正相关趋势,即随着蛋白质互作比例的增加,相关基因共调控的强度也随之增强.结论 互作蛋白(基因)倾向于被共调控.