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目的：查明广西北部地区汉坦病毒的基因型及其基因亚型。方法用RT-PCR方法检测鼠肺中的汉坦病毒并对M和S片段进行扩增和测序。下载已知毒株序列并进行比较，以明确其基因型及其亚型。结果2011年采集宿主动物肺组织标本356份，RT-PCR 检测阳性12份。S 片段与汉城型汉坦病毒（SEOV）的同源性较高，在86.6%-88.9%之间，与汉滩型汉坦病毒（HTNV）的同源性较低，在73.5%-74.0%之间。系统进化分析显示属于汉城型汉坦病毒的S6亚型。结论广西北部地区汉坦病毒基因型为汉城型汉坦病毒S6亚型。