【摘 要】
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基于亚洲棉29729条纤维相关EST(Expressed sequence tag)序列和亚洲棉基因组序列,并结合雷蒙德氏棉(G.raimondii)NAC(NAM/ ATAF /CUC)转录因子家族的研究结果,利用生物信息学
【机 构】
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西南大学园艺园林学院,中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室
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基于亚洲棉29729条纤维相关EST(Expressed sequence tag)序列和亚洲棉基因组序列,并结合雷蒙德氏棉(G.raimondii)NAC(NAM/ ATAF /CUC)转录因子家族的研究结果,利用生物信息学方法,鉴定出143个亚洲棉NAC转录因子家族基因;利用实时荧光定量PCR技术对30个NAC转录因子构建表达图谱,鉴定出7个基因在亚洲棉纤维细胞次生壁加厚期优势表达,进一步明确了它们在亚洲棉、雷蒙德氏棉和陆地棉中的表达模式差异.利用RT-PCR(Reverse transcription-polymerase chain reaction)技术克隆得到了3个NAC基因全长cDNA,将其命名为GaNA C20、GaNA C09和GaNA C69,初步的生物信息学分析发现GaNAC20和GaNAC)9基因均含有3个外显子和2个内含子,GaNAC69含有4个外显子和3个内含子,为进一步研究奠定了良好基础.
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