10株广西猪圆环病毒3型(PCV3)全基因组序列的遗传变异分析

• 作 者: 卢冰霞 刘磊 周英宁 何颖 秦毅斌 段群棚 李斌 陈忠伟 梁
• 机 构: 广西兽医研究所广西兽医生物技术重点实验室
• 出 处: 中国兽医杂志
• 发表日期: 2020年3期
• 关键词: 广西 PCV3 全基因 遗传变异 Guangxiporcine circovirus type 3genomegenetic variation
• 基金项目: 广西科技重大专项(桂科AA17204057),广西水产畜牧科技推广应用项目(桂渔牧科201528032,201528030,201633034),广西基本科研业务费专项(桂科专项15-2,16-2,17-2),南宁市科学研究与技术开发计划课题(20172135-3),柳州市柳江区科学研究与技术开发计划课题(201709)

为了解广西猪群猪圆环病毒3型(PCV3)的遗传变异情况,以PCV3阳性DNA为模板,利用PCR的方法分2段扩增PCV3全基因序列并进行拼接,获得10株PCV3全基因组序列,全长均为2000 bp。10株广西PCV3全基因组序列之间的核苷酸同源性为98.6%~99.8%。与国内其他毒株的同源性为97.9%~99.8%;与国外其他毒株的同源性为98.8%~99.7%。10株广西PCV3 Cap基因的大小均为645 bp,编码214 aa。PCV3 Cap基因比较保守,10株广西PCV3 Cap基因与参考株相比