【摘 要】
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目的筛选椎间盘退变(IDD)组织与非退变组织间的关键(hub)基因,并进一步分析IDD组织中免疫细胞浸润情况。方法从GEO数据库下载IDD表达谱芯片数据集,利用R软件筛选退变组织与非退变组织中的差异表达基因(DEGs),然后构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),筛选出hub基因。最后首次利用科学的反卷积算法(CIBERSORT)分析IDD组织中免疫细胞的浸润情况,以揭示免疫细胞浸润在IDD中的作用。结果共筛选出166个DEGs和10个hub基因。免疫细胞浸润分析发现,IDD组织中单核细胞与调节性T细胞
【机 构】
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兰州大学第二医院骨科,甘肃省骨关节疾病研究重点实验室
【基金项目】
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脊柱疾患疼痛机制研究及治疗甘肃省国际科技合作基地(甘科外[2017]2号-34),兰州大学创新创业培育项目(cxcy201906),兰州大学第二医院2019年博士研究生培养专项基金项目(YJS-BD-09)。
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目的筛选椎间盘退变(IDD)组织与非退变组织间的关键(hub)基因,并进一步分析IDD组织中免疫细胞浸润情况。方法从GEO数据库下载IDD表达谱芯片数据集,利用R软件筛选退变组织与非退变组织中的差异表达基因(DEGs),然后构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),筛选出hub基因。最后首次利用科学的反卷积算法(CIBERSORT)分析IDD组织中免疫细胞的浸润情况,以揭示免疫细胞浸润在IDD中的作用。结果共筛选出166个DEGs和10个hub基因。免疫细胞浸润分析发现,IDD组织中单核细胞与调节性T细胞
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