【摘 要】
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目的:了解深龋微生物碳水化合物活性酶特征.方法:收集第一恒磨牙深龋浅层和深层样本共16份,提取DNA后基因组高通量测序.测序结果比对NCBI nr及CAZy数据库,分析深龋微生物组成
【机 构】
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华中科技大学同济医学院附属协和医院口腔医学中心 湖北 武汉 430022;口腔颌面发育与再生湖北省重点实验室 湖北 武汉 430022;华中科技大学同济医学院口腔医学系 湖北 武汉 430022
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目的:了解深龋微生物碳水化合物活性酶特征.方法:收集第一恒磨牙深龋浅层和深层样本共16份,提取DNA后基因组高通量测序.测序结果比对NCBI nr及CAZy数据库,分析深龋微生物组成及碳水化合物活性酶特点.结果:深龋微生物在CAZy库中注释的酶家族主要为糖苷水解酶(47.28％),其次为糖基转移酶(35.37％),辅助氧化还原酶最少(0.38％).相对丰度前10的活性酶主要集中在GH13和GH1家族.拟杆菌门包含相对比例最多的活性酶基因,且深龋浅层和深层微生物碳水化合物活性酶模式无明显差异(P>0.05).结论:深龋浅层及深层微生物碳水化合物活性酶特征相似,基因组的酶谱分布提示其代谢蔗糖和淀粉类植物源性碳水化合物有遗传优势.拟杆菌门具有更广泛的碳水化合物底物.
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