基于高通量测序方法分析荣成月湖潮间带趋磁细菌多样性

• 作 者: 张文燕 潘红苗 董逸 杜海舰 陈一然 吴龙飞 肖天
• 机 构: 中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室,青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室,中国科学院大学,中国科学院海洋大科学研究中心,中法趋磁多细胞生物进化与发育联合实验室,法
• 出 处: 海洋科学
• 发表日期: 2019年3期
• 关键词: 潮间带 多样性 趋磁细菌 高通量测序 intertidal zone diversity magnetotactic bacteria high-through
• 基金项目: 国家自然科学基金项目(No.41776131,41776130),国家自然科学基金-山东联合基金(U1606404,U1706208).

摘要:荣成月湖是一个典型天然潟湖,潮间带沉积物中存在多种形态趋磁细菌。通过Roche454高通量测序平台,对沉积物样品(B_S)和磁收样品(B_M)进行16SrRNA基因高通量测序,认识荣成潮间带沉积物的细菌群落结构,并了解趋磁细菌多样性及系统进化地位。研究结果表明沉积物样品中主要的细菌类群为δ-变形菌纲,占总细菌数的26.4%,其次是γ-变形菌纲和α-变形菌纲;而磁收样品中细菌多样性和种类明显降低,以α-变形菌纲占绝对优势,相对比例达72.6%。在磁收样品和沉积物样品分别发现了1612条和186条rea