【摘 要】
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目的 应用生物学软件预测结核分枝杆菌Rv2878c基因编码蛋白mpt53的结构和功能. 方法 从NCBI中获得Rv2878c基因及其编码序列,通过ORF Finder、ProtParam、ProtScaleon Expasy
【机 构】
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潍坊医学院医学检验学院,山东潍坊261031;潍坊医学院病原生物学教研室
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目的 应用生物学软件预测结核分枝杆菌Rv2878c基因编码蛋白mpt53的结构和功能. 方法 从NCBI中获得Rv2878c基因及其编码序列,通过ORF Finder、ProtParam、ProtScaleon Expasy、TMHMM Server v.2.0、Signa1P 4.1 Server、TargetP 1.1 Server、NetPhos 3.1 Server、BLAST、SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred、SYFPEITHI、STRING等工具预测分析mpt53蛋白的相关生物学信息. 结果 Rv2878c基因全长为922 bp,有8个开放阅读框架,其编码蛋白mpt53由1 72个氨基酸组成,等电点5.19,为含有信号肽的非跨膜蛋白;该蛋白含有21个磷酸化位点,1个保守域,18个(得分≥0.80)B细胞抗原表位和8个(得分≥15)T细胞抗原表位;二级结构预测mpt53中α螺旋占32.56％,β-折叠占23.84％,β-转角占7.56％,无规则卷曲占36.05％.富集分析显示该蛋白与氧化还原反应有关. 讨论 生物学信息分析mpt53蛋白为分泌蛋白,可用于研发结核病血清学诊断试剂.蛋白的二级结构助于氧化折叠,是抗结核药物的潜在靶点;该蛋白含有有大量潜在的T、B细胞抗原表位,是结核病疫苗的候选蛋白.
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