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最佳免疫时间是在临床症状出现前的9星期进行。因此不管是何时首次免疫，与二免的间隔时间应为3星期，二免后需要经过2星期才能产生保护力。因此在此期间，存在支原体免疫的空白期。但主要的灭活苗厂家仍然推荐7／21日龄接种。通过很多现场血清学调查发现，保育猪的第1次接种灭活苗的最适时间是4～7周龄。因此，如果支原体肺炎在断奶结束或转群后发病，首免应该在1周龄，二免则在4周龄；如果发病时间是在13～15周龄，免疫时间应在4周龄和7周龄；如果发病时间在育肥的后期，则免疫时间应为7周龄和10周龄。