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茎瘤芥的质量安全包括优质、安全两方面含义。优质是指茎瘤芥的外观内质，以瘤茎圆整、表皮青绿光滑、皮下肉质白而肥厚、质地脆嫩无空心、菜筋（纤维管束）少、单个重200～500g为上品。质量保证主要通过规范化栽培技术而实现。安全是指危害因素，如农药残留、重金属污染、放射性元素、有害微生物及其次生代谢物等对人、动植物、环境的危害和潜在危害。主要运用HACCP而实现安全控制。