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根据国家与地方中长期科技发展战略定位的不同，介绍了福建省自然科学基金成立的背景及其发展过程，分析了新近出台的《福建省自然科学基金管理办法》，特别是对基金的设立目的、定位和申报条件、立项程序、过程管理等进行了分析。最后，从如何更有利于提高地方自主创新能力入手，对下一步省级自然科学基金的管理创新提出若干对策建议。