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针对重叠藻细胞显微图像的计数问题,提出一种基于活动轮廓模型的重叠藻细胞自动计数方法。对重叠藻细胞显微图像进行预处理,标记连通域,提取并处理局部图像,采用活动轮廓模型算法提取重叠藻细胞边缘,同时进行边缘分析和计数。与传统分水岭算法相比,该计数方法不直接进行重叠藻细胞分割,可以消除因直接分割时过分割与欠分割导致的计数误差,提高重叠藻细胞计算准确度。实验结果表明,该方法对重叠藻细胞的计数准确率高于90%。