白令海北部表层沉积物中细菌多样性的研究

• 作 者: 邹扬 曾胤新 田蕴 郑天凌
• 机 构: 厦门大学生命科学学院,中国极地研究中心,厦门大学
• 出 处: 极地研究
• 发表日期: 2009年01期
• 关键词: 白令海 沉积物 细菌 多样性
• 基金项目: 国家自然科学基金(项目编号40676002);国际极地年中国行动计划;长江学者和创新团队发展计划项目(40521003)资助。

提取白令海表层沉积物样品总DNA,构建沉积物中的细菌16SrDNA文库,通过RFLP酶切分型与序列测定,进行沉积物中的细菌多样性及系统发育分析。结果表明,该沉积物中细菌多样性丰富,获得的125条序列归属于10个细菌类群,包括占据优势地位的变形细菌(Pro-teobacteria,49.6%)、酸杆菌门(Acidobacteria,20.8%),以及拟杆菌门(Bacteroidetes,6.4%)、放线菌门(Actinobacteria,5.6%)、浮霉菌门(Planctomycetes,5.6%)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae,4%)、疣微菌门(Verrucomicrobia,2.4%)、绿弯菌门(Chloroflexi,1.6%)、纤维杆菌门(Fibrobacteres,0.8%)、螺旋体(Spirochaetes,0.8%)。此外,还有一部分分类地位尚不明确的细菌(2.4%)。而在变形细菌中,δ、γ亚群为其中的优势类群。