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采用ISSR分子标记，以1个普通油茶实生苗作为对照，对我国南方10个油茶优良无性系进行了遗传多样性分析。实验从99条引物中筛选出多态性较高的16条ISSR引物进行PCR扩增，共扩增出135个位点，其中多态性位点数为114个，多态性位点比率为84．44％。基因型间的平均遗传距离（GD）为0．419，其中优良无性系与对照之间的GD值相对较大，平均为0．58。聚类结果表明，油茶优良无性系与普通油茶实生苗存在较大的遗传差异，同时也较准确地进行了各优良无性系的分子鉴别，为油茶的良种选育提供了理论依据。