【摘 要】
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为了验证中国林业微生物保藏管理中心库藏链格孢属(Alternaria Nees)菌种资源分类地位的准确性,探索一种链格孢属真菌的快速复核鉴定方法,采用ITS序列分析、NCBI blast以及系
【机 构】
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中国林业科学研究院,中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,中国林业科学研究院林业研究所
【基金项目】
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中国林业科学研究院院长基金“重要林业生物资源收集、保存、评价与利用”(CAFYBB2011005-3);国家微生物资源平台专项经费“林业微生物库藏资源管理与共享”(NIMR-2011-7)
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为了验证中国林业微生物保藏管理中心库藏链格孢属(Alternaria Nees)菌种资源分类地位的准确性,探索一种链格孢属真菌的快速复核鉴定方法,采用ITS序列分析、NCBI blast以及系统发育分析等方法,对中国林业微生物保藏管理中心库藏链格孢属的36个种及未定种的375个菌株进行分子复核鉴定以及系统发育关系研究。结果表明:研究的375个菌株中,有21个菌株的分类地位不准确,其中有9株菌的ITS序列与链格孢属菌种的同源性在92%～96%之间,另外12株菌的ITS序列与链格孢属菌种的同源性在60%～85%之间。基于ITS序列构建的NJ树显示,29个小孢子种的37个生物型形成了一个稳定的分支,而6个大孢子种与外群Ulocladium sp.聚在一个分支。本研究中,ITS序列分析可以用来区分和鉴定形态差别明显的大孢子种,但无法区分亲缘关系较近的29个小孢子种。
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