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针对智能全站仪在诸如FAST等尖端科学实验中的广泛运用,对全站仪动态测量数据序列特征进行分析的基础上,提出综合运用回归分析去除运动趋势项、小波降噪减弱偶然误差项和频谱分析提取系统误差项等方法对动态测量数据进行处理,从而可以获得仪器进动跟踪带来的系统误差频率,在合作目标运动角速度为128 pps时系统进动误差频率为0.2~0.4 Hz,并与理论分析结果相比较,比较结果说明该方法实用有效,有一定应用价值。