山西苹果褪绿叶斑病毒的分布及遗传多样性分析

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苹果褪绿叶斑病毒Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV)是侵染苹果的主要潜隐性病毒之一,在我国苹果植株上发生普遍,严重威胁我国苹果的品质与产量.本研究从山西省12个苹果主产区随机采集360份表现褪绿和斑驳等症状的苹果叶片作为研究样本,通过RT-PCR检测,360份样本中有209份样本为ACLSV阳性,对209份阳性样本的外壳蛋白(coat protein,CP)基因进行分离、测序、克隆,得到12个新的ACLSV分离物(分别命名为Shanxi1~Shanxi12).选择17个来自不同国家的分离物与12个新的ACLSV分离物在核苷酸和氨基酸层面上进行序列一致性和系统发育分析.结果 显示,29个ACLSV分离物被划分为2个不同进化群体.进一步对2个不同ACLSV群体进行选择压分析和中性检验,结果表明,组工与组Ⅱ的ACLSV群体之间存在明显的遗传差异,其中负向选择可能是ACLSV遗传变异的原因之一.本研究较全面地分析了ACLSV的发生、危害,并对山西苹果的ACLSV分离物进行了遗传结构分析,为山西苹果褪绿叶斑病毒病的防治提供了理论指导.
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