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目的：社区获得性肺炎（CAP）、急性咳嗽、支气管炎及下呼吸道感染（LRTI）通常由病毒或肺炎链球菌感染引起。先前较少对这些疾病患者的非典型病原体（肺炎支原体、肺炎衣原体、嗜肺军团杆菌及百日咳博德特氏菌）检出率进行总结。本文从现有文献入手，获取检出率信息。方法系统检索 MEDLINE，收集关于患有 CAP、咳嗽、急性支气管炎、LRTI 的门诊患者的肺炎支原体、肺炎衣原体、嗜肺军团杆菌及百日咳博德特氏菌的检出率的前瞻性研究。两位作者对文章进行评议，包括对数据的纳入和提取；差异通过共识讨论解决。采用随机效应模型，对每种病原体进行 Meta 分析，计算合并检出率。结果50项研究符合纳入标准。在 CAP 患者中，肺炎支原体、肺炎衣原体的总检出率分别为10.1%〔95% CI（7.1%，13.1%）〕和3.5%〔95% CI（2.2%，4.9%）〕。虽然嗜肺军团杆菌的总检出率为2.7%〔95% CI（2.0%，3.4%）〕，但是其在儿童中较为罕见，在1765例中仅有1例。在长期咳嗽的患者中，百日咳博德特氏菌的检出率为12.4%〔95% CI（4.9%，19.8%）〕，但是其在包括儿童的研究中更高〔17.6%，95% CI（3.4%，31.8%）〕。结论非典型病原体是包括咳嗽、支气管炎、CAP 等下呼吸道疾病中相对常见的病因。具备监测数据的情况下，研究发现在所有患者都接受这些病原体检测的研究中，非典型病原体的检出率更高。