菜豆黄花叶病毒中国和叙利亚蚕豆分离物外壳蛋白的序列分析(英文)

来源 :植物病理学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:malongqingse
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
病毒病是影响云南省蚕豆生产的重要病害。对采集的蚕豆病毒病标样进行了组织印迹法检测,表明菜豆黄花叶病毒(BYMV)是最主要的病原。据此,以BYMV基因的保守序列设计了一对特异性引物,用BYMV的5个中国云南蚕豆分离物和1个叙利亚蚕豆分离物侵染的蚕豆叶片总RNA为模板,RT-PCR扩增获得了长度为907bp的目标片段。序列分析显示,此片段中包含822bp的外壳蛋白序列。6个分离物间的外壳蛋白核苷酸和推导编码蛋白质的氨基酸序列的同源性分别为86.4%~100.0%和96.7%~100.0%。与GenBank登录的34个具有完整外壳蛋白序列的BYMV分离物进行同源性和系统进化树分析的结果表明,6个分离物在核苷酸和氨基酸水平上与其它分离物的同源性分别为79.1%~97.9%和83.5%~98.5%,BYMV中国蚕豆分离物与日本蚕豆分离物同源性最高。外壳蛋白基因的序列特征揭示,在BYMV中的蚜传相关基序为NAG。 Virus disease is an important disease that affects the production of faba bean in Yunnan Province. The collected virus samples of Vicia faba were detected by histological blot, which indicated that BYMV was the most important pathogen. Based on this, a pair of specific primers was designed based on the conserved sequence of BYMV gene. The total RNA of Vicia faba leaves infected by 5 Chinese Yunnan faba bean isolates from BYMV and 1 Syrian faba isolate was used as a template for RT-PCR amplification The length of 907bp target fragment. Sequence analysis showed that this fragment contains 822bp of the coat protein sequence. The homologies of coat protein nucleotide and deduced amino acid sequence of the six isolates were 86.4% -100.0% and 96.7% -100.0%, respectively. The results of homology and phylogenetic tree analysis of 34 BYMV isolates with complete coat protein sequences registered in GenBank showed that the homologies of the 6 isolates with other isolates at the nucleotide and amino acid levels were 79.1% -97.9% and 83.5% -98.5%, respectively. BYMV isolates from China showed the highest homology with Japanese faba bean isolates. The sequence characteristics of coat protein genes revealed that the aphid-associated motif in BYMV is NAG.
其他文献
随着循证医学理念在我国医学领域的普及,要求医师将最好的研究证据、患者利益、临床实践有机结合,在选择一项医疗措施的时候,不仅要注意其临床结果,如有效率、治愈率、敏感性
会议
本文以城市住宅的社会学问题为对象,分析我国目前相关研究领域的状况和面临的主要课题,进而提出展开系统化的住宅社会学研究对我国城市住宅的发展与建设具有迫切而深远的意义
本文在回顾和分析当前我国居住区规划设计实践与理论的基础上,引入生态学中的"群落"概念,通过对"住宅群落"生态、社会、环境行为内涵的阐释,积极探索一种新的住区规划设计理
随着甲状腺结节及甲状腺癌发病率的上升,国内外开始重视甲状腺及甲状旁腺相关疾病的治疗.目前,甲状腺癌的首选治疗方式是手术治疗,手术的并发症主要是喉返神经和甲状旁腺损伤
期刊
本文首次提出了营造城市居住生活区心理环境的概念,通过分析人的心理与环境的关系,深入浅出地引出了心理环境的存在,并阐明了营造良好心理环境的必要性,以及如何从硬环境和软
目的探讨诱导大鼠原位膀胱癌动物模型早期应用雌激素干预,观察其膀胱的成瘤情况、肿瘤大小及病理分级有无影响。方法给切除卵巢的SD大鼠行N-甲基亚硝基脲(MNU)膀胱灌注,每次2
随着综合治疗的快速发展和进步,乳腺癌患者的长期生存率得到极大改善,患者对生活质量的要求日益提高.外科治疗是改善乳腺癌患者术后生存质量的关键.在上述背景下,通过近现代1
本文依据模糊模式识别、子集度测度理论,提出一种适应性子集度测度神经网络的负荷时间序列预测的新方法;该方法可在线地学习神经网络的结构和参数,确定连接方式和神经元节点.
本文利用双权值神经元模型,提出了一种新的双权值神经网络结构,研究了双权值神经网络的非线性映射逼近理论,证明了它可以实现对一类非线性反馈系统的任意程度逼近.
加强装备储备的研究,是打赢未来信息化战争的客观要求,是军队装备建设发展的必然选择.在对装备储备规模进行分析的基础上,利用人工神经网络及BP网络理论,建立装备储备规模的