【摘 要】
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利用大规模DNA序列测定的方法,对猪脂肪组织进行了表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)序列测定,获得高质量EST共7790个,并对此进行了初步分析.使用STACK_PACK软件进行
【机 构】
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西安交通大学医学院,中国科学院北京基因组研究所,西安交通大学医学院
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利用大规模DNA序列测定的方法,对猪脂肪组织进行了表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)序列测定,获得高质量EST共7790个,并对此进行了初步分析.使用STACK_PACK软件进行聚类分析,得到4 354个基因聚类,包括3 609个单拷贝基因和745个多拷贝基因;将候选基因序列用BlastN与nr库进行比较(e＝1e-10),从4 354个候选基因中得到2 712个已知基因,其中单基因为1 987个,多拷贝基因为725(3 694克隆)个;未知功能基因和新EST有2 109
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