【摘 要】
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目的 对我国嗜吞噬细胞无形体分离株进行多间隔序列分型（MST）分型。方法根据GenBank收录的4株无形体全基因组序列，利用Mauve 2.3.1软件行种内基因组比对，选择具有变异间隔区进行引物设计，通过引物特异性及扩增效率等预实验筛选引物，并对实验菌株进行PCR扩增，分析单核苷酸多态性（SNPs）。将每株菌间隔序列拼接后进行分型分析并构建进化树，分析不同地区、不同动物种类来源菌株遗传变异关系。结
【机 构】
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中国疾病预防控制中心传染病预防控制所无形体室,北京102206,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所无形体室,北京102206
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目的 对我国嗜吞噬细胞无形体分离株进行多间隔序列分型（MST）分型。方法根据GenBank收录的4株无形体全基因组序列，利用Mauve 2.3.1软件行种内基因组比对，选择具有变异间隔区进行引物设计，通过引物特异性及扩增效率等预实验筛选引物，并对实验菌株进行PCR扩增，分析单核苷酸多态性（SNPs）。将每株菌间隔序列拼接后进行分型分析并构建进化树，分析不同地区、不同动物种类来源菌株遗传变异关系。结果共筛选出22对引物，用于我国11株无形体分离株MST分型，SNPs分析显示，碱基转换发生率最高（60.2%，251/417），其中A-G转换居首（18.9%，79/417），颠换占23.0%（96/417），插入及缺失发生率占16.7%（70/417）。11株菌22条间隔序列拼接后（约11047 bp）均为独立变异型。进化分析发现山东省莱州地区重症患者分离株（LZ-H1、H2、H3、H4、H5）及当地长角血蜱分离株LZ-T1与美国Webster株及HZ株聚为一簇，而北京分离株BJ-H1与新疆分离株XJ-H1和XJ-H3聚为一类。莱州地区另一蜱分离株LZ-T2与新疆另外一人源分离株聚为一类，与莱州重症患者分离株遗传关系密切。结论我国无形体分离株间隔序列存在明显的遗传多态性，MST分型技术可用于无形体疫情暴发时的快速诊断和疫情追踪。
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