基于TCGA数据库分析miRNA在肝癌中的表达差异及预后关系

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目的

探讨miRNA在肝癌中的表达差异,建立其与肝癌预后的关系。

方法

提取TCGA数据库中的肝癌样本的miRNA表达量及肝癌临床数据,根据正常组织与肿瘤组织分为两组,通过edgeR算法对比两组数据的miRNA表达量。联合差异miRNA与临床生存时间作生存分析,寻找对肝癌预后产生影响的miRNA。

结果

肝癌组织对比正常组织共发现247个差异表达miRNA(P<0.01),通过生存分析发现17个差异miRNA与预后相关(P<0.05),Cox多因素分析结果提示miRNA-30d、miRNA-939、miRNA-188、miRNA-5003与肝癌患者生存时间相关(P<0.05),差异均有统计学意义。

结论

miRNA-30d、miRNA-939、miRNA-188、miRNA-5003在肝肿瘤组织对比正常组织表达差异且肝癌预后相关,对miRNA在肝癌领域的研究具有借鉴价值。

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