【摘 要】
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目的 初步了解申克孢子丝菌Sec14基因DNA、mRNA、蛋白的生物学特征及功能位点.方法 生物信息学方法分析申克孢子丝菌Sec14基因DNA、mRNA、蛋白的生物学特征.结果 申克孢子丝
【机 构】
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中山大学附属第三医院皮肤性病科,广东广州,510630;中山大学孙逸仙纪念医院皮肤科,广东广州,510120;中山大学附属第三医院检验科,广东广州,510630;中山大学附属第三医院全科医学,广东广州
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目的 初步了解申克孢子丝菌Sec14基因DNA、mRNA、蛋白的生物学特征及功能位点.方法 生物信息学方法分析申克孢子丝菌Sec14基因DNA、mRNA、蛋白的生物学特征.结果 申克孢子丝菌Sec14基因启动子可能位于其基因编码区起始位点前224～274 bp处,包含转录起始位点-265 bp,该基因无内含子;Sec14 mRNA含有丰富转录调节元件,并含有microRNA结合位点;Sec14p样蛋白由351个氨基酸残基构成,分子量为39×103Mr,理论等电点为5.25,二级结构主要由α-螺旋和无规卷曲构成,Sec14p样蛋白的三级结构呈现典型的球状结构,包裹一个疏水性口袋,该区域含有磷脂分子结合区域,蛋白还分布着丰富的磷酸化位点及2个二分裂核定位信号.吡啶酰胺小分子化合物在磷脂分子结合区域与蛋白相作用,结合能为-6.5 kcal/mol,蛋白还具有丰富的抗原表位.Sec14p样蛋白序列在大部分真菌中一致性较好,同源性高.结论 申克孢子丝菌Sec14基因具有典型真菌基因组基因特征,mRNA可变性高,其编码蛋白的磷脂分子结合位点可作为新型小分子的药物靶点.
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