分析牙髓卟啉单胞菌（Porphyromonas endodontalis ，Pe）和不同毒力牙龈卟啉单胞菌（Porphyromonas gingivalis ，Pg）表达量相近的蛋白，筛选Pe潜在的毒力因子。
方法将Pe ATCC35406分别与Pg高毒力株Pg W83、低毒力株Pg ATCC33277进行全细胞蛋白质组学比较，采用相对和绝对定量同位素标记（isobaric tags for relative and absolute quantitation ，iTRAQ）与纳升液相色谱串联质谱（nano liquid chromatography-tandem mass spectrometry, Nano-LC-MS/MS）相结合的比较蛋白质组学技术，通过同位素标记肽段、质谱检测和生物信息学分析等方法，分析Pe ATCC35406分别与Pg W83、Pg ATCC33277之间表达相近的蛋白数及蛋白的生物学功能。
结果Pe ATCC35406和Pg W83比较时共鉴定到1 210个蛋白，其中表达量相近的蛋白130个（占蛋白总数的10.74%），包括89个功能蛋白和41个未知功能蛋白；Pe ATCC35406和Pg ATCC33277比较时共鉴定到1 223个蛋白，其中表达量相近的蛋白110个（占蛋白总数的8.99%），包括72个功能蛋白和38个未知功能蛋白。Pe ATCC35406与不同毒力的Pg表达相近的蛋白集中在外膜蛋白和蛋白酶，包括有致病作用的重组活化基因A (recombination activation gene A, RagA）、脂蛋白、伴侣蛋白Dnak、Clp家族蛋白（ClpC和ClpX）以及多种铁结合蛋白等，主要行使催化活性和结合功能，参与代谢和细胞进程。Pe ATCC35406与Pg W83表达相近的毒力蛋白种类和数目相对多于与低毒力Pg ATCC33277表达相近的蛋白。
结论脂蛋白、氧气耐受蛋白、铁结合蛋白等可能为Pe ATCC35406潜在的毒力因子，Pe的致病能力与高毒力Pg更接近。